Vor dem Ausgraben der Bäume sollten die Blätter entfernt werden. Dies geschieht meistens manuell. Seien Sie vorsichtig, wenn Sie Blätter waschen, um die Knospen und jungen Zweige nicht abzubrechen. Nach dem Waschen empfiehlt es sich, die Bäume prophylaktisch mit Topsin M in einer Konzentration zu besprühen 0,1%.
Bäume werden manuell oder mit speziellen Traktorpflügen ausgegraben. In großen Baumschulen werden Bäume fast ausschließlich mit dem Pflug ausgegraben. Arbeiter nehmen die Bäume unter Schnitt aus dem Boden. Je nach Arbeitsorganisation werden die Bäume nach dem Ausreißen sortiert, und dann in Bündeln danach gebunden 10 Stücke und legt sie in die zuvor mit einem Traktorpflug gepflügten Furchen. Die so angeordneten Baumbündel werden mit einem Traktorpflug abgedeckt. Vorübergehend entkernte Bäume verbleiben in der Gärtnerei, bis sie von Käufern abgeholt werden. In Gärtnereien mit großen Hallen werden oft verwandte Bäume dorthin gebracht und in getrennten Sortenblöcken horizontal angeordnet. Das Wurzelsystem der Bäume wird dann bis zu ihrer Ernte durch häufiges Besprühen mit Wasser bei hoher Luftfeuchtigkeit gehalten.
Baumbündel, die für die Anlage von Großobstwiesen bestimmt sind, sollten mit zwei Etiketten gekennzeichnet werden. Einzelne Bäume sollten jedoch in Bündeln für den Einzelverkauf gekennzeichnet werden.